Cancer Imaging Archive(TCIA)는 연구자들에게 다양한 의료 영상 데이터를 제공하는 공공 리소스입니다. 본 글에서는 TCIA 사용법과 함께 DICOM이미지 파일을 다운로드하는 과정에 대해서 설명해 드리겠습니다.
Cancer Imaging Archive란?
Cancer Imaging Archive(TCIA)는 암 연구를 위한 의료 영상 데이터를 공유하는 플랫폼으로, 연구자들이 다양한 영상 데이터를 활용하여 암 진단 및 치료 개선을 연구할 수 있도록 지원합니다. 이 플랫폼은 CT, MRI, PET 등 여러 형식의 의료 영상을 포함하고 있으며, 데이터는 익명화되어 개인정보가 철저히 보호됩니다.
TCIA는 미국 국립 암 연구소(NCI)와 협력하여 개발된 오픈 액세스 리소스로, 전 세계 연구자들이 무료로 접근할 수 있습니다. 데이터를 통해 암 연구의 질을 높이고, 학술 및 임상적 발전에 기여하는 것을 목표로 합니다.
NBIA Data Retriever 다운로드 및 설치
Cancer Imaging Archive에서 관심 있는 이미지를 검색하여 장바구니에 추가하고 다운로드하면 NBIA Data Retrivever프로그램을 통해 다운로드할 수 있는 파일이 저장됩니다. 의료 데이터를 받기 위해서는 NBIA Data Retriver가 필요한데 이를 다운로드해 보겠습니다.
NBIA Data Retriever는 Windows, MacOS, Linux 등 다양한 운영체제에서 사용할 수 있는 프로그램입니다. 먼저, 공식 NBIA 홈페이지에 접속하여 자신의 환경에 맞는 버전을 선택하여 다운로드하세요.
의료 데이터 샘플 데이터 다운로드하기
검색 페이지 접속: Cancer Imaging Archive 홈페이지에서 검색 페이지로 이동합니다.
데이터 탐색: 검색창에 키워드를 입력하거나 좌측의 카테고리 필터를 사용하여 원하는 데이터를 찾아보세요.
예를 들어, 폐암 CT 스캔 데이터인 LIDC-IDRI를 검색하면 관련 결과가 표시됩니다.
저는 LIDC-IDRI ct스캔 데이터를 다운로드하여 보겠습니다.
페이지 하단에 DICOM포맷의 다운로드 옵션을 제공하고 있습니다. NBIA Data Retriever를 다운로드하였으니 바로 다운로드할 수 있는데 데이터의 양이 방대하기 때문에 SEARCH를 통해 받고자 하는 데이터를 선택해 보겠습니다.
Text Search를 통해 원하는 텍스트를 검색하거나 좌측의 메뉴를 통해 찾고자 하는 옵션에 맞게 분류할 수 있습니다. 원하는 자료를 찾았으면 Cart탭의 아이콘을 클릭하여 무료로 다운로드할 수 있습니다.
장바구니에 데이터 추가
- 데이터 선택: 검색 결과에서 필요한 데이터 세트를 선택합니다.
- Cart 탭 이용: 선택한 데이터를 장바구니(Cart)에 추가합니다. 이 기능을 사용하면 다운로드하려는 데이터를 효율적으로 관리할 수 있습니다.
장바구니에 추가한 데이터는 NBIA Data Retriever를 사용하여 다운로드할 수 있습니다.
다운로드 절차
저장 위치 선택: 다운로드 데이터를 저장할 폴더를 지정합니다.
다운로드 시작: 데이터를 다운로드하면 각 파일이 지정된 저장 위치에 저장됩니다. 데이터 양에 따라 시간이 소요될 수 있습니다.
의료 데이터 샘플 확인하기
다운로드 데이터들을 살펴보면 dcm파일이 함께 다운로드된 걸 확인할 수 있는 DICOM뷰어를 통해 파일을 확인할 수 있습니다. 뷰어를 통해 이미지를 보는 방법은 이전에 설명드린 DICOM의 개념과 뷰어에 관한 게시물을 참고해 주세요.
뷰어를 통해 의료 데이터의 품질과 내용물을 확인할 수 있습니다. 다운로드한 데이터의 세부 정보를 검토하고 분석할 때 유용합니다.